市教育局的主要职能是综合管理全市基础教育、职业技术教育、成人教育、市属高等教育,指导协调各县区、各部门的有关教育工作。

具体职责是:会同有关部门制定筹措教育经费、教育拨款、教育基建投资等规范性文件;鼓励、支持和规范社会力量办学;主管全市教师工作;指导、推动九年义务制教育的实施和教育结构调整以及教学改革、学校布局调整和规范中小学用书;拟定职业技术、成人教育的发展规划,指导扫除青壮年文盲工作;制定市属高校、中等职业学校和成人高等学校的招生计划,组织招生考试和录取工作;负责各类大中专毕业生、毕业研究生的就业指导、服务和管理工作;制定教育督导评估工作方案并组织实施;指导全市教育教学研究、现代技术、电化教育及勤工俭学工作。

根据上述职责,局机关内设了办公室、政策法规科、政工科、计划财务科、基础教育科、职业教育与成人教育科、教师工作科(挂永州市语言文字委员会办公室)、民办教育管理科、学生资助管理科、体育卫生与艺术教育科、审计科、监察室等科室,所属事业单位有:市教育工会、市人民政府教育督导室、市勤工俭学管理站、毕业生就业管理办公室、市教育考试院、市教育科学研究院、市电化教育馆(教学仪器站)、湖南广播电视大学永州分校、道县师范学校、祁阳师范学校、永州一中、永州四中、永州市特殊学校。